01
CÓMPUTO CIENTÍFICO
Transformar preguntas en análisis
Combina métodos computacionales y conocimiento científico para procesar información, realizar simulaciones y contribuir a la generación de evidencia.
DEPARTAMENTO DE BIOINFORMÁTICA
COCOXCALLI: Supercómputo para la investigación
Cocoxcalli es una infraestructura de cómputo de alto rendimiento orientada a apoyar el trabajo científico mediante recursos computacionales, software especializado y acompañamiento técnico para estudiantes e investigadores..
Investigación
Impulso al trabajo científico
Software especializado
Herramientas para cada proyecto
Acceso compartido
Recursos para múltiples usuarios
TECNOLOGÍA PARA LA CIENCIA
¿Qué es el cómputo científico?
Es el uso de computadoras, modelos matemáticos, métodos numéricos y simulaciones para estudiar problemas complejos de ciencia e ingeniería. Permite analizar datos, explorar escenarios y comprender fenómenos que serían difíciles de estudiar con herramientas convencionales.
02
HIGH PERFORMANCE COMPUTING
Más recursos trabajando en conjunto
El cómputo de alto rendimiento (HPC) reúne recursos de procesamiento y memoria —por ejemplo, mediante un clúster de computadoras— para ejecutar tareas exigentes de manera eficiente.
¿Cómo te apoyamos?
Servicios para la investigación
La infraestructura se acompaña de orientación técnica para facilitar el uso responsable y eficiente de los recursos computacionales.
Procesamiento de datos
Apoyo para ejecutar tareas que requieren mayor capacidad de cómputo, memoria o tiempo de procesamiento. Envío de Jobs
Software especializado
Instalación, configuración y orientación sobre herramientas computacionales, según los requerimientos del proyecto y la compatibilidad técnica.
Bases de datos especializadas
Gestión y configuración de bases de datos biológicas especializadas, adaptadas a las necesidades de los proyectos de investigación. Ver BD disponibles
Capacitación y asesoría
Orientación a estudiantes e investigadores sobre el acceso a la infraestructura, la línea de comandos y la ejecución de software especializado en bioinformática. Ver cursos disponibles
NUESTRA FINALIDAD
Supercómputo al servicio de la ciencia.
La infraestructura busca facilitar el acceso a herramientas computacionales que contribuyan al desarrollo de investigaciones en distintas áreas y disciplinas.
COCOXCALLI
Infraestructura para la investigación científica
Facilitar el acceso a recursos especializados
Acercar capacidad de cómputo y software a estudiantes e investigadores del CISEI-INSP, conforme a los mecanismos de acceso establecidos.
Optimizar tiempos de procesamiento
Apoyar el análisis de grandes volúmenes de datos y la ejecución de tareas computacionalmente demandantes.
Promover el aprendizaje
Ofrecer capacitación y orientación para fortalecer las habilidades computacionales de la comunidad usuaria.
Compartir infraestructura
Organizar el uso de recursos computacionales entre múltiples usuarios y proyectos, de acuerdo con la disponibilidad y las políticas del servicio.
LA PLATAFORMA
Infraestructura de cómputo
Cocoxcalli integra recursos de cómputo y servicios de software destinados a apoyar los flujos de trabajo científicos. La configuración concreta se administra de acuerdo con las necesidades técnicas y la disponibilidad de la infraestructura.
Recursos compartidos para tareas exigentes
El clúster permite organizar la ejecución de trabajos y aprovechar los recursos disponibles sin depender únicamente de una computadora personal.
Tipo de infraestructura
Servidores especializados
Comunidad objetivo
Estudiantes e investigadores
Área de apoyo
Bioinformática y ciencia de datos
Acceso
Mediante solicitud y autorización
Solicitar cuenta
Las políticas de uso de la infraestrcutura de cómputo puede consutarlas aqui: Políticas de uso HPC
INFRAESTRUCTURA FÍSICA
Los servidores detrás de la investigación
Conoce los equipos que integran Cocoxcalli y los recursos computacionales disponibles para apoyar los proyectos científicos.
NODO DE CÓMPUTO
Biocluster4
Máquina Virtual
ProcesadorIntel Xeon E5-2630 v3 @ 2.40 GHz (virtualizado).
Núcleos32 CPU lógicas.
Memoria RAM94 GiB
AlmacenamientoAlmacenamiento a través de NAS
NODO DE CÓMPUTO
Steinman
HP z800
Procesador2 × Intel Xeon X5675 @ 3.07 GHz.
Núcleos12 núcleos físicos (2 procesadores de 6 núcleos cada uno)
Memoria RAM 48 GB
Almacenamiento2.6 TB y Almacenamiento a través de NAS
NODO DE CÓMPUTO
Burnet
Dell Power Edge R810
Procesador2 × Intel Xeon E7520 @ 1.87 GHz.
Núcleos8 núcleos físicos (4 por procesador), con 16 hilos lógicos.
Memoria RAM32 GB
Almacenamiento665 GB y Almacenamiento a través de NAS
SERVIDOR NAS (Network Attached Storage)
Kitasato
Dell Power Edge R730
Procesador2 × Intel Xeon E5-2609 v3 @ 1.90 GHz.
Núcleos12 núcleos físicos (6 por procesador), 12 hilos lógicos.
Memoria RAM32 GB
Almacenamiento22 TB
SERVIDOR NAS (Network Attached Storage)
Almacén
Máquina virtual
ProcesadorIntel Xeon Gold 6230N @ 2.30 GHz (virtualizado)
Núcleos4 CPU lógicas asignadas
Memoria RAM8 GB
Almacenamiento6.9 TB
NODO DE CÓMPUTO
Honjo
Máquina virtual
ProcesadorIntel(R) Xeon(R) CPU E5-2630 v3 @ 2.40GHz (virtualizado)
Núcleos12 CPU lógicas asignadas
Memoria RAM 32 GB
AlmacenamientoAlmacenamiento a través de NAS
07
NODO DE CÓMPUTO
Nombre del servidor 07
Fabricante y modelo
ProcesadorPor definir
NúcleosPor definir
Memoria RAMPor definir
AlmacenamientoPor definir
08
NODO DE CÓMPUTO
Nombre del servidor 08
Fabricante y modelo
ProcesadorPor definir
NúcleosPor definir
Memoria RAMPor definir
AlmacenamientoPor definir
ADMINISTRACIÓN Y ACOMPAÑAMIENTO
Responsable de la infraestructura
La administración técnica contribuye a mantener la disponibilidad de los recursos, orientar a las personas usuarias y coordinar las necesidades de software y cómputo de los proyectos de investigación.
Ing. Karla Leslie Matias Valdez
Responsable de cómputo de alto rendimiento
Departamento de Bioinformática · CISEI, Instituto Nacional de Salud Pública
karla.matias @insp.mx y bioinformatica.cisei @insp.mx Para solicitar acceso, capacitación u orientación técnica, contacta al equipo responsable por los canales institucionales correspondientes.